出口退税预审系统显示通过，仅代表企业提交的电子数据在形式上符合基本要求。系统对报关单、发票信息的逻辑关系进行了初步校验。这远非退税流程的终点。预审通过后，申报资料将进入更为严格的正式审核环节。诸多潜在问题在此阶段逐一暴露，导致税款最终无法退付。
单证备案与信息一致性瑕疵
税务部门的正式审核侧重单证的真实性与合规性。预审通过的单证可能在细节上存在致命缺陷。
单证备案不合规
出口退税要求企业完整备案全套单证。包括出口货物报关单、增值税专用发票、海运提单或运单、收汇凭证等。报关单上的出口日期与提单日期存在不合理差异。海运提单收货人信息与合同买方不一致。增值税进项发票的品名、单位、数量与报关单信息存在微小出入。这些单证间的矛盾足以导致审核不通过。
跨部门信息比对异常
税务部门与海关、外汇管理局进行数据交叉比对。企业申报的报关单号在海关系统中可能状态异常，例如已被结关或删单。外汇监测系统显示该笔出口货款未按规定时限收汇，或收汇金额与申报退税金额严重不符。这类跨部门信息异常，预审系统未必能完全捕捉。
企业资质与业务真实性存疑
税务机关对业务实质的审查远超纸质单证。
供应商链条风险传导
退税审核延伸至企业的上游供应商。若供货企业被认定为非正常户，或已走逃失联。其开具的增值税专用发票将被列为异常凭证。即使企业不知情，其基于这些发票申请的退税也将被暂停甚至追回。这是当前退税审核的重点领域。
业务逻辑与生产能力不匹配
税务部门会评估企业业务的合理性。新成立企业短期内出口额暴增。生产企业出口的商品明显超出其设备产能与用工规模。外贸企业出口的商品与其以往经营品类毫无关联。这些异常迹象会触发税务部门的实地核查。企业若无法合理解释资金流、货物流与合同的一致性，退税将被否决。
政策理解与操作失误
企业对复杂退税政策的误读直接导致退税失败。
- 出口商品编码归类错误，本应适用免税或征税政策，企业误申请退税。
- 退税申报超期。货物报关出口之日次月起至次年4月30日前的最后一个增值税纳税申报期截止日前，未完成申报。
- 四类企业（纳税信用等级D级、海关失信企业、外汇管理分类为C级、曾被查出过骗税行为的企业）申报退税时，需提供收汇材料。企业未按规定提交。
- 用于退税的增值税专用发票在综合服务平台中未进行退税勾选，错误勾选为抵扣。
系统与流程性阻碍
技术性因素也不容忽视。国库退库流程中出现问题，如企业提供的退税账户名称与账号有误，或账户状态异常。税务局内部审核流程时间较长，尤其在年底或申报高峰期。企业误以为预审通过即万事大吉，未及时跟进后续状态。
企业面对预审通过却退不下来的困境，应立即与主管税务机关退税部门沟通。获取具体的审核疑点说明。逐项排查单证、业务、资质与操作流程。问题根源往往隐藏在形式合规之下的实质要件缺失之中。
